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WangLabCSU/Curated-List

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Curated-List (收藏清单)

Repo Size License Bioinformatics Data Science AI & ML

整理我的浏览器收藏夹,太多年了~!放在这里的目的是为了方便整理和查找,针对团队成员的一些学习和培养,有专门整理的一些初步资料方便最基础入门。

本次更新根据最新的 Edge 浏览器收藏夹进行了全面、系统、深度的梳理与去噪,过滤了所有个人账户、内网系统、行政管理、敏感隐私以及与学术开发无关的链接,并按照七大专业分类将其模块化管理,以提高日常科研与软件开发的检索效率。


🗺️ 仓库导航与系统架构 (Repository Architecture)

下图展示了当前仓库经系统化重构后的分类框架:

graph TD
    Root[Curated-List 主索引] --> Cat1[📚 学术研究与科研工具]
    Root --> Cat2[🧬 生信分析与计算工具]
    Root --> Cat3[🗄️ 生物医学数据库]
    Root --> Cat4[💻 软件开发与系统配置]
    Root --> Cat5[📊 数据科学与绘图可视化]
    Root --> Cat6[🧠 人工智能与机器学习]
    Root --> Cat7[🎓 学习教程与博客社区]
    
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📂 分类列表索引 (Category Index)

模块列表 描述摘要 核心收录主题
📚 学术研究与科研工具 科研日常学术服务与论文工具 学术期刊、科研绘图、论文润色与投稿、学术团队、实验协议、文献检索
🧬 生信分析与计算工具 基因组与多组学计算分析软件 NGS、单细胞测序、HLA分型、变异检测与注释、生存分析、数字病理、生信流程
🗄️ 生物医学数据库与在线平台 全球大型生命医学和多组学数据库 综合数据中心、TCGA、ICGC、单细胞转录组、免疫组学、药物反应、注释数据库
💻 软件开发与系统运维 跨平台语言开发、工具配置与部署 R/Python/Go/Rust/Julia开发、VS Code配置、系统调优、Docker容器化、通用库
📊 数据科学与绘图可视化 数据预处理、统计建模与绘图设计 数据清洗、统计分析、机器学习建模、数据可视化、排版字体、配色方案
🧠 人工智能与机器学习 深度学习与大语言模型前沿工具 传统机器学习、神经网络架构、LLM本地推理引擎、在线AI平台、AI搜索
🎓 学习教程与博客社区 开发者学习资料、技术问答与社区 编程书籍(R/Python/Go)、在线课程、官方文档、开发者社区、经典技术博文

🌟 核心精选与快速入门 (Core Highlights & Quick Start)

本节保留并优化了原清单中最核心、最适合团队入门与打底的黄金资源,方便新成员快速检索和上手:

🏁 学习入口 (Learning Gateways)

📖 核心入门书籍 (Essential Books)

🛠️ 开发工具与语言

🧬 计算生物与统计

📁 基础生物信息格式 (Common File Formats)

🪞 常用开源软件镜像站 (Mirror Services)


🤝 参与和贡献

如果您有优秀的生信工具、数据库或开发资源推荐,欢迎提交 Pull Request!为保证本清单的学术性、纯净性与公共服务性,提交时请遵循以下规则:

  1. 严格学术相关:不收录个人账户页面、任何带有 session 信息或需内部认证的私有链接。
  2. 剔除冗余与低质:不收录临时查询页面、重复的搜索引擎主页、已失效的死链。
  3. 清晰分类:根据资源的主要功能,放置于对应的子 Markdown 文件中,并保持名称简洁。

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A Curated Reading List Maintained by Shixiang and His Team

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